Louise Hvarfner föddes torsdagen 25 april 2002. Hon spelade ungdomsfotboll i FC Djursholm och i Djurgårdens IF. Med FC Djursholm spelade hon även en seniormatch i division II mellersta Svealand 2017 innan hon gick till Djurgårdens akademi.

Louise Hvarfner debuterade för Djurgården och i Damallsvenskan lördagen 11 juli 2020 i 0⁠–⁠1-förlusten borta mot Linköpings FC på Arena Linköping. Hon spelade tolv damallsvenska matcher under sin debutsäsong.